是与光电子学研究所实行院所合一的教学科研并重型学院，拥有测控技术与仪器和光电信息工程2个本科专业，光学工程、物理电子学、电路与系统3个硕士点，光学工程博士点和博士后流动站，其中，光学工程为广东省重点学科。学院已形成本科—硕士—博士完整的人才培养体系。

1999年9月，著名光电子学专家牛憨笨院士及科研团队从中科院西安光机所调入深圳大学，组建光电子学研究所，并于2006年8月建立光电工程学院。学院现有“光学工程”博士点，“光学工程”和“电子科学与技术”两个一级学科硕士点，以及“测控技术与仪器”、“光电信息科学与工程”和“光源与照明”三个本科专业。“光学工程”学科2007年被评为广东省重点学科，并经国家人事部批准建立了光学工程博士后科研流动站。学院已经形成从本科—硕士—博士到博士后完整的人才培养体系，以及围绕光电子科学与技术方向完整的学科群。

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